Река берет свое начало в крохотном моренном озерке на восточных склонах одноименной горы, стоящей обособленно на слабо заболоченном водоразделе, где кроме Б.Пайпудыны берут начало еще три крупных уральских реки: Большая Уса, Большой Харбей и Лонготеган. Абсолютная высотная отметка истока 286 м, отметка устья при впадении в реку Собь у железной дороги – 126 м. Общая протяженность реки — 55 км, но пригодной для сплава на резиновых лодках она становится лишь когда мелкие протоки, преодолев широкую долину, сливаются с Золотым ручьем (почти 20 км от истока). В этом же месте расположен перекресток двух старых трансполярноуральских санно-гусеничных дорог. Одна пересекает Полярный Урал от берега Оби на Воркуту, другая проходит вдоль хребтов от перевала нынешней железной дороги у ст.Полярный Урал и пос. Полярный по долине Б.Пайпудыны и далее, через озера Хадата, Щучье до Байдарацкой губы. По одной в 30-е годы протащили оборудование для первой воркутинской шахты, другая на протяжении 60 лет обеспечивала изучение Полярного Урала одноименной геологоразведочной экспедицией.
Сплав по рекам (на фото — Большая Лагорта)
